Desde 2006 a Native realiza periodicamente o inventário das emissões de gases de efeito estufa (GEE) da produção orgânica regenerativa de cana, açúcar e álcool da Usina São Francisco (UFRA), baseado no GHG Protocol, modelo internacional de quantificação das emissões. A avaliação considerou desde a produção agrícola de cana e o consumo de insumos, a fase industrial da produção do açúcar e do álcool na Usina, até o transporte, comercialização e consumo dos produtos, tanto no mercado interno quanto externo. Trata-se de uma abordagem denominada Análise de Ciclo de Vida, popularmente conhecida por contabilizar as emissões do processo "do berço ao túmulo".

Os valores verificados para a UFRA são menores que os valores médios de emissão do setor, devido aos métodos orgânicos de produção. Quando comparados à produção realizada na Europa ou Japão, a partir da beterraba, ou dos EUA, a partir do milho e da beterraba, as vantagens são ainda maiores. Isso ocorre porque se trata de métodos produtivos que utilizam energia proveniente da queima de combustíveis fósseis, enquanto, na UFRA, a energia provém da queima do bagaço da cana.